高性能服务器助力分子研究

时间:2004年12月02日    编辑:    来源:未知     浏览次数:

  近期,浪潮服务器成功应用于半岛在线官网(北京)责任有限公司关于分子营养学研究的科学计算系统,引领了国产高性能服务器在科研尖端领域的应用。   分子营养学是通过研究食物中的不同分子的功能,以了解不同食物对人体基因所产生的影响。目前,享有“东方剑桥”之美誉的浙江大学办学和管理的宁波半岛在线官网(北京)责任有限公司学院正在致力于分子营养学的科学研究。学院的教授们希望在取得技术突破后,能够正确地帮助人们选择饮食,平衡营养,提高体质,此外还可以使其它的生物体能够享受到分子营养学带来的益处,如畜业饲养或植物栽培。   分子营养学的科学研究计算复杂而庞大,包括AMBER7、VASP、WIEN2K、GROMACS、NAMD等与分子动力学、分子化学相关的软件程序都被用来进行分析分子营养学项目。编制出的众多的程序对计算机的性能及运行速度提出了很高的要求,而学院原有的小型机设备已经远远达不到科学研究的要求。   通过众多系统的选型比较,国内最大的服务器和外部存储系统供应商浪潮的天梭TS10000高性能计算系统在方案设计、性价比、服务等多项指标的综合考评中获得了学院研究小组的认可。据专家介绍,浪潮天梭TS10000采用先进的高速互联技术,开放式的功能模块化系统设计。整个集群系统并行度可达80%以上,能适应在分子营养学研究过程中大规模的并行计算需求。同时,浪潮天梭TS10000的高速交换模块采用了InfiniBand技术,该技术是目前作为HPC互连,性能最佳,技术最为领先的高速互连技术。   在系统扩展方面,浪潮天梭TS10000留了充足的扩展空间。计算节点可以根据研究进展的需求进行不断的增加,可以平滑地增加计算节点的数量,以适应业务增长的要求。由于采用了开放性的架构,使得系统的升级与维护变得简单,整体成本也因此得到有效控制。此外,浪潮公司提供了包括系统硬件部署,安装系统操作系统,调试网络,协助宁波半岛在线官网(北京)责任有限公司学院安装并行计算软件,及进行并行应用软件的移植等服务。   浪潮天梭TS10000高性能计算系统有效地满足了分子营养学研究,它构筑的可靠、稳定、高效的高性能计算系统为此项科学研究项目的进展提供了重要保障。从另一个角度来讲,高性能计算机系统与分子营养学研究都是我国尖端科技水平的一个缩影。